Действия Tom Clancy's Splinter Cell Blacklist развиваются спустя шесть месяцев после событий, рассказанных в Conviction. К этому времени «Третий эшелон» был расформирован.
Новой угрозой выступает террористическая организация из Ближней Азии, которая грозит США серией терактов, если правительство не прекратит свою интервенцию в их страны. Высказанные угрозы были составлены в так называемый «черный список» – если требования террористов не будут удовлетворены, они начнут последовательно их исполнять. Президент США не находит лучшего решения, кроме как обратиться к Сэму Фишеру. Главный герой соглашается, но на особых условиях – будет создан «Четвертый эшелон», управлять которым станет он сам, а его помощником выступит Анна Гримсдоттир. Понимая, что угроза от террористов слишком велика, президент дает Сэму «Пятую свободу», позволяющую совершать любые действия для защиты первых «Четырех свобод».
Игровой процесс Tom Clancy's Splinter Cell Blacklist имеет ряд новых возможностей по сравнению с предыдущими частями. Теперь есть возможность на бегу отметить цели и совершить красочное убийство.
Не последнюю роль в данной версии Splinter Cell: Blacklist будет играть контроллер Wii U GamePad. С его помощью игроки смогут использовать инновационные гаджеты, убивать противников точными выстрелами, передвигаться по местности и переключаться между пистолетом и винтовкой. Кроме того, контроллер будет использоваться для управления Snake Camera — миниатюрным устройством, которое позволяет заглядывать в замочные скважины.